國產固相萃取儀在固相萃取中通常的方法是將固體吸附劑裝在個針筒狀柱子里，使樣品溶液通過吸附劑床，樣品中的化合物或通過吸附劑或保留在吸附劑上（依靠吸附劑對溶劑的相對吸附）。“保留”是種存在于吸附劑和分離物分子間吸引的現象，造成當樣品溶液通過吸附劑床時，分離物在吸附劑上不移動。國產固相萃取儀保留是三個因素的作用：分離物、溶劑和吸附劑。所以，個給定的分離物的保留行為在不同溶劑和吸附劑存在下是變化的。“洗脫”是種保留在吸附劑上的分離物從吸附劑上去除的過程，這通過加入種對分離物的吸引比吸附劑更強的溶劑來完成。

　　國產固相萃取儀因其對沸點低的高分子化合物的精度較高，在生物醫藥行業有較為廣泛的應用。用來分離生物分子的聚合柱長期使用會被污染，從而較低柱效，影響檢測的速率和靈敏度。因此，須定期進行清潔。聚合材料的化學穩定性通常以作用力來衡量。般情況下，國產固相萃取儀主要使用硝酸或氫氧化鈉溶液來清洗。些反相聚合色譜柱的清洗方法如用聚苯乙烯－二乙烯基苯小球和聚合單體，如CIM RP－SDVB片和Swift柱子，能耐寬的pH范圍（通常pH11～13或有時pH0～14），但使用者用強有機溶劑沖洗柱子時要注意，由其交聯度決定，當柱子用某些有機溶劑沖洗時就會膨脹或收縮。高于8～10%交聯度的聚合物通常有較好的機械性能在水溶液中收縮很少，在有機溶劑中膨脹也不大。

　　為確保國產固相萃取儀再生的效果，建議在使用溶劑沖洗色譜柱之前，了解色譜柱的填料類型以及確保使用的溶劑能與柱子的填料相容。硅膠基質的柱子通常來說都是相容的，但有機聚合物基質的柱子可能會在某些溶劑組合中膨脹或收縮，這樣會影響色譜柱的柱效。